Nephila fenestrata usa il suo pungiglione per sottomettere le prede principalmente a scopo riproduttivo. Il veleno può avere una serie di effetti, da lieve a grave paralisi, sui suoi invertebrati bersaglio come i blatte, che usa per fornire una fonte di cibo viva per le sue larve. L'esposizione al pungiglione porta a diversi gradi di immobilizzazione, garantendo la sopravvivenza della prole di nephila fenestrata. Anche se il pungiglione è in generale una minaccia per gli insetti, altri animali in genere non incontrano rischi significativi dal comportamento difensivo di nephila fenestrata.

Nephila fenestrata generalmente non mordono gli esseri umani, poiché non sono aggressivi nei confronti delle persone. Nei rari casi in cui queste punture si verificano, sono tipicamente un meccanismo di difesa contro minacce percepite. Il morso di nephila fenestrata non è dannoso, causando sintomi lievi simili a una puntura d'ape.

Nephila fenestrata non sono intrinsecamente pericolosi per gli esseri umani, ma la loro presenza può causare angoscia. Di solito, sistemano le loro ragnatele in aree frequentate dalle persone. Un incontro accidentale con una ragnatela o con il ragno stesso potrebbe scatenare una puntura difensiva, anche se è raro e di solito si verifica solo in seguito a provocazioni dirette o maneggiamento inappropriato.

Per prevenire problemi con nephila fenestrata, la pulizia regolare degli spazi interni e la manutenzione delle aree esterne sono utili. Questo include abbattere qualsiasi ragnatela visibile e assicurarsi che la vegetazione densa vicino agli spazi abitativi sia ben potata. Scoraggiare la loro presenza tramite l'uso di repellenti naturali come olio di eucalipto o di menta piperita può essere efficace.

Nel caso di un incontro con nephila fenestrata che provoca disagio, mantieni pulita l'area interessata e usa un impacco freddo per lenire eventuali irritazioni minori. Tecniche di distrazione come coinvolgersi in attività o ascoltare musica possono anche aiutare a ridurre il disagio. È importante rimanere calmi e evitare di disturbare ulteriormente la ragnatela o nephila fenestrata. Chi ha sintomi persistenti dovrebbe consultare un professionista per interventi non medici e ulteriori consigli per ridurre il disagio.